Эти слова - паронимы. В стихотворении Леонида Губанова "Полина" есть строчки: "Полина! Полынья моя! Когда снег любит -                                      значит, лепит, А я, как плавающий лебедь, В тебе, не помнящей меня". Мало кто сходу может сказать, что такое полынья. А вот растение полынь знают, хотя не все смогут описать или назвать хотя бы одно отличительное свойство. Но полынь горькая. А текст как раз о горьких, болезненных чувствах - полынь бы очень органично в него вписывалась. Немудрено, что я решила: полынья - это та же полынь...

Полынь (лат. Artemisia; др.-греч. ἀρτεμισία) — трава, характерная своей горечью, древнее название которой, очевидно, связано с богиней охоты и дикой природы Артемидой, считавшейся также богиней врачевания. В силу своих целебных свойств и свойств, расширяющих сознание, полынь издревле используется знахарями, колдунами, магами, ведуньями, ясновидящими и яснослышащими. Народные названия данной травы — чернобыльник, горечь, нехворощ, глистник, вдовья трава, божье дерево, трава Святого Иоанна, емшан, лунная трава...