Первый храм во имя святителя Филиппа был построен в монастыре в 1688 году напротив Трапезной палаты, в северо-западном ряду келий. Он был пристроен к больничным палатам и считался больничным храмом. Больничные кельи появились в монастыре еще при святителе Филиппе. Известно, что с начала XVII века в монастыре была больница и для мирских людей. В конце XVIII века больничные кельи перенесли в южную часть центрального двора. В братском больничном корпусе жили схимники и престарелые старцы, на верхнем этаже до начала XX века размещалась больница с аптекой...

Православная Церковь 16 июля вспоминает перенесение мощей святителя Филиппа из Соловецкого монастыря в Москву в 1652 году. Святитель Филипп до избрания на московскую кафедру служил игуменом Соловецкого монастыря, а в 1566-м стал митрополитом Московским и всея Руси. Он открыто выступал против опричнины царя Ивана Грозного, за что попал в опалу и спустя два года лишился сана. В конце 1569-го приближенный царя Малюта Скуратов убил святителя Филиппа. Сначала его похоронили в Отроче монастыре, но в 1591 году монахам Соловецкого монастыря разрешили перенести мощи чудотворца в родную для него обитель...