В мире, где привычное потрескивание дозиметра — это саундтрек к выживанию, радиация стала чем-то большим, чем просто невидимый убийца; она превратилась в фон для истории, полной неожиданной человечности. Серый рассвет едва пробивался сквозь плотную завесу туч, когда Игорь перешагнул порог разрушенного кирпичного здания на окраине Рыжего леса. Счётчик Гейгера на поясе привычно потрескивал, напоминая о том, что каждая минута здесь может стать последней. Воздух вокруг казался густым и тяжелым, пропитанным невидимой угрозой, которую могло зафиксировать только оборудование...

Игра начинается с ролика, в котором группа учёных во главе со сталкером куда-то тихо брела. Но вдруг, что-то произошло. Сначала псевдопсы побежали, а потом и произошёл выброс. После ролика вы приходите в сознание, глава группировки Чистое Небо по имени Лебедев сообщил вам, что вы выжили после выброса, его люди нашли вас на болотах. Все вас называют наёмником Шрамом. После разговора идите к бармену, он немного расскажет о группировке, а потом идите в штаб к Лебедеву. В ходе разговора он попросит...