1 Во вступительном видеоролике показано, как Шрам сопровождает ученых, всю группу накрывает выбросом, и в результате этого Шрам теряет свой «Винторез». Этот «Винторез» можно обнаружить в северной части локации «Болота», достаточно вспомнить, как выглядела местность на ролике.[2] Как видно из того же начального ролика, Шрам был одет в кожаный плащ. Однако когда он приходит в сознание уже на базе «Чистого Неба» на нем кожаная куртка. 2 На базе группировки «Чистое Небо» на полке (как игровое наполнение) в спальне Лебедева лежит штык-нож от АК-74, который в игре в виде оружия нигде не появляется...

STALKER: Clear Sky (Сталкер Чистое Небо) – крутой динамичный экшен, продолжающий серию «Сталкер» с новым героем, новым интересным сюжетом, новой графикой и переработанным геймплеем. Сюжет второй части рассказывает о мощном энергетическом выбросе, произошедшем на территории Зоны. Этот выброс серьёзно повлиял на отношения между группировками. Выброс породил новые поля артефактов, которые и стали толчком к противостоянию между группировками. Сотни сталкеров устремились к Центру в надежде отыскать артефакты и обогатиться за их счёт на Большой земле...