С самого начала игры персонажа знакомят с двумя сторонами локального конфликта в Скайриме: Братьями Бури и Имперскими войсками. Игроки выбирают одну из сторон, исходя из идеологических соображений или просто основываясь на случайном выборе. В играх часто можно встретить разветвлённые глобальные сюжетные линии в двух направлениях, и различные концовки, которые равносильны между собой и призваны создать ощущение, что от игрока что-то зависит. Но в рассматриваемой игре стороны не равносильны и в ней было найдено указание на то, кто победит...