Сюжет мода Золотой Обоз 2 начинает свое развитие сразу после событий представленных в прологе, где Скиф отправившись в Рыжий Лес, попадает под выброс. События берут свое начало в Рыжем Лесу - Скиф приходит в себя в хижине у Лесника. От него он узнает, что на Затоне произошел мощный выброс - и все обитатели покинули Затон перед началом выброса. Также Скиф рассказывает Леснику о цели визита в Рыжий Лес - поиск клада в шахтах. Но вот незадача - шахты под контролем группировки Грех, которые могут пропустить к себе на базу только в обмен на редчайший артефакт - Сердце Саркофага...

Вот уже 11 лет прошло с выхода последней части трилогии S.T.A.L.K.E.R. Зов Припяти. Студия GSC тут же начала создание "второго сталкера", но по каким-то причинам, студия распалась. Обычные геймеры взяли на себя эту задачу, и начали улучшать игру на свой цвет и вкус...