Игра начинается драматичными образом, продолжая предыдущую часть. Подбивают Звездалет Нормандия и ваше тело собирают по частям за боснословные деньжище. Удивляют так же доктора военного ученого группировки Цербер и создают Нормандию 2. Миру как обычно угрожают опасность от неизвестных расс Жнецов. Только вы в силах спасти мир! В дальнейшем Cerber дает задания. Вы путешествует по галактики, проникая в команду лучщих бойцов. И начинается битва с кораблем скарабеем. В некоторых станциях можно выполнять побочные миссии и погулять даже что крайне интересно...

Выпущен новый мод Mass Effect Legendary Edition для ПК, который восстанавливает внутриигровые консольные команды. Поклонники оригинальной серии на ПК, скорее всего, вспомнят использование игровых консольных команд для разблокировки оружия, навыков, брони, опыта и многого другого. Для ремастера Mass Effect от EA уже были выпущены различные моды, но внутриигровые консольные команды больше не работают из-за изменения файлов игры. К счастью, моддер «ME3Tweaks» теперь выпустил новый мод, который снова...