События Resident Evil 3 разворачиваются в те же дни, что и Resident Evil 2 — 28 сентября — 1 октября 1998 года. Пока Леон и Клэр пробивались через полицейский участок и подземную лабораторию, Джилл Валентайн уже пыталась выбраться из Раккун-Сити. Она пережила кошмар в особняке и знает, что Umbrella — это зло. Она не хочет больше иметь с ними ничего общего. Но когда город охватывает эпидемия, Джилл понимает, что её единственный шанс — покинуть Раккун-Сити до того, как он будет уничтожен. Однако у Umbrella другие планы...

Прошло не много времени с тех пор, как Джилл Валентайн сумела отделаться от своих злоключений в оригинальной Resident Evil. Но когда она возвращается в Раккун-Сити, то обнаруживает, что весь инцидент с корпорацией Umbrella был скрыт от обычных людей. Разочарованная в организации S.T.A.R.S., девушка покидает их ряды и отправляется на поиски своего друга Криса Редфилда. По слухам, Крис находится в Европе, где он занят расследованием местного подразделения Umbrella. Но прежде чем Джилл удается покинуть...