Сюжет Действия одиночной компании, в отличие от других игр серии, происходят уже далеко за пределами нашей планеты. Земляне, которым сильно не хватало ископаемых и ресурсов, отправились искать их в других местах Солнечной системы. Все бы хорошо, если бы далеко от планеты Земля, на Марсе, не зародилось движение колонизаторов-повстанцев, жаждущих власти. Никто не был готов к тому, что это движение, назвавшее себя Фронтом Обороны Колоний (СДФ), собрало огромную армию и начало длительную и жестокую войну с Землей, надеясь захватить бразды правления в свои руки...

Главной темой игры, на первый и поверхностный взгляд, является старая-добрая борьба хороших против плохих. Но всё немного не так просто, как может показаться. Итак, главным героем является лейтенант Ник Рейес, обладатель идеализированного взгляда на методы ведения войны. Он считает, что необходимо соблюдать кодекс чести, а главная задача командира - сохранить как можно больше жизней своих подчинённых. Он не понимает, как можно устраивать парад в честь дня Звёздного Флота, когда погибли четверо оперативников на Европе...