Сюжет (как это принято у игр этого жанра) рассказывается буквально в двух словах. Как ни странно, этих слов оказалось достаточно. 2060 год от рождества Христова.На землю из глубин бездушного космоса высыпают орды строггов - инопланетных кибернетических захватчиков...

В некотором смысле, Quake это уникальная франшиза: все игры серии радикально отличаются друг от друга, у франшизы нет общего сюжета, нет единой игровой вселенной, нет какого либо смысла в происходящем...