После окончания Войн клонов армия Великой Армии Республики медленно трансформировалась в безликих имперских штурмовиков, и долгое время клоны Джанго Фетта оставались главной силой зарождающейся Империи, продолжая нести службу с привычной яростью и преданностью. Ситуация изменилась, когда в ряды начали внедрять солдат естественного происхождения. Обе фракции испытывали взаимную ненависть: штурмовики считали ветеранов устаревшими, а клоны видели в новобранцах мягкотелых слабаков, недостойных великого наследия прошлого...

Приквелы "Звёздных войн" пролили свет на Войны Клонов, загадочный конфликт, впервые упомянутый Оби-Ваном Кеноби "Новой надежде". Начало Войн Клонов было показано "Атаке клонов", где была представлена Великая армия Республики. Это, в свою очередь, привело к созданию сериала "Войны клонов", который раскрыл события самой войны, а также представил новых персонажей-клонов, таких как капитан Рекс. Позже клоны жестоко предали джедаев, исполнив Приказ 66, отданный Палпатином. Клонов для армии Республики создавали на планете Камино...