Alien Shooter 2 привнес серию много изменений. Наемников на выбор дают больше – 8 человек. Сами они обзавелись именами, биографиями и уникальными навыками, вроде вампиризма и регенерации. Появилась возможность расстреливать и давить монстров на транспорте. Сюжет стал более внятным. Героя теперь часто сопровождают десантники. История рассказывает о неудачных экспериментах корпорации М.А.Г.М.А. Она посылает бойцов в секретные лаборатории. Им необходимо разобраться с ордами тварей и добыть важную информацию...