Токен или смарт-карта является персональным устройством и должен находиться у пользователя. Их удаленное использование противоречит самой идее применения аппаратных средств подписи и аутентификации. Если вам всё-таки необходимо удаленное соединение, то самым правильным способом будет подключить токен или смарт-карту к локальному компьютеру, а подключение произвести через «Удаленный рабочий стол» (Remote Desktop Protocol, RDP). Если всё же возникла ситуация и носитель нужно подключить удаленно, то...

Одно из первых и самых проблемных вопросов при внедрении Linux в офисе, это 1С и другие службы, которые без Windows практически не могут. Что касается 1С, то есть варианты настройки и под Linux и под wine и много других способов...