Root — учетная запись в операционной системе с правами суперпользователя. Тонкую настройку системы под веб-проект можно выполнить на выделенном сервере, где всеми ресурсами физической машины распоряжается один клиент. Он может размещать на сервере проекты любой нагруженности и настраивать систему под них. Его административные решения не могут помешать другим пользователям, поэтому он полностью свободен в своих действиях. Однако не каждому проекту нужен целый сервер для размещения всех данных, программ и технологий...

Папка Windows old или Windows.old предназначена для восстановления и отката к предыдущей версии системы после того как Вы перешли на новую (как правило это касается крупных версий обновлений, вроде 1701, 1803 и пр), но она Вам чем-то не понравилась, работает не стабильно или что-то еще. По сути своей эта папка является резервной копией (бекапом) прошлой...