Первая причина в сотнях и тысячах зависимостей, которые рано или поздно приводят к конфликтам (Dependency Hell). Б - безопасность, это вторая причина, почему репозитории не лучший источник приложений, вредоносные пакеты то и дело проникают туда, собственно, а почему бы и нет? Ведь гораздо проще заразить централизованный репозиторий с софтом для Linux, чем бегать по всему интернету пытаясь "взломать" множество независимых источников для Windows. Особое внимание заслуживает непереносимость пакетов, что есть следствие конфликта зависимостей, как это проявляется? Пакеты из репозиториев MX Linux 23...

Чем хороши репозитории? Чем плохи репозитории? Брр, пожалуй хватит, а то слишком много текста получилось, хотя говорить о недостатках репозиториев в Desktop сегменте можно ещё очень долго. Давайте перейдём к более интересной ситуации! Обычно, когда люди "говорят плохо" про Linux, обязательно находятся явно неадекватные фанаты "дряхлого пингвина", которые начинают рассказывать как у них всё прекрасно работает, а если случаются проблемы - то виноват обязательно пользователь, но ни в коем случае не линуксоидный кривой софт, а если чего-то нет - значит "оно не надо"...