FFmpeg - очень мощный инструмент с открытым исходным кодом (читай - бесплатный), который позволяет конвертировать и незначительно редактировать аудио и видео файлы. Мне он нравится за кроссплатформенность и возможность работы из командной строки, что помогает автоматизировать процесс. Хотелось бы сразу предупредить, что "из коробки" данный продукт не имеет графического интерфейса. Если Вам нужен GUI, можете установить его от сторонних разработчиков самостоятельно. Установка FFmpeg. Linux На Linux...

Бесплатный конвертор аудио, видео. Склейка видео, аудио, картинок, обрезка, вытаскивание аудиодорожек и множество других возможностей