Немного про выравнивания. Консенсусные последовательности и выравнивания в Geneious
В прошлый раз я рассказала, как работать с контигами в Geneious. Допустим, вы их просмотрели, приняли решение по каждому нуклеотиду. Обрезали, если посчитали нужным. Что дальше? Для анализа надо сделать выравнивание. Оно нужно для того, чтобы сопоставить позиции разных последовательностей друг с другом, и понять, в какой позиции произошли замены. Ниже я привожу ссылки на некоторые видео о том, как работают разные алгоритмы. Однако таких видео в интернете много, они разные по длительности, по освещаемым аспектам, на разных языках...
10 месяцев назад
Открытие 2023 года: Y-хромосома человека наконец-то полностью секвенирована и раскрывает свои секреты
Международная группа ученых впервые полностью секвенировала Y-хромосому человека, заполнив ранее имевшиеся пробелы в ее последовательности и добавив в нее 30 млн нуклеотидов. Это поможет в изучении особенностей полового развития, сперматогенеза, а также болезней, сцепленных с Y-хромосомой. Результаты исследования опубликованы в журнале Nature. Y-хромосома, как и X-хромосома, является половой хромосомой человека и важна в контексте полового развития. Хотя первое прочтение генома человека было представлено 20 лет назад, в последовательностях всех 24 хромосом оставались пробелы...