Систематика пресмыкающихся — штука сложная уже потому, что как их ни объединяй, группа всё равно рискует получиться парафилетической, то есть составной с точки зрения естественной, по происхождению от общего предка, классификации. Если мы захотим считать рептилиями и змей, и черепах, нам придётся считать ими и крокодилов, и динозавров, и птиц как подгруппу динозавров. Но считать птиц рептилиями мы определённо не хотим. А монофилетической, то есть происходящей от одного предка, будет только надотряд лепидозавров...