Второй закон Ньютона. МД это не обязательно молекулы, это модель* динамики(движения) чего угодно, но чаще всего атомов или молекул. Просто исторически так сложилось, что первые модели описывали молекулярные структуры, например лёд. Поэтому так и называют - молекулярной динамикой МД - это ВИРТУАЛЬНАЯ РЕАЛЬНОСТЬ строго работающая по 2-му закону Ньютона, во времени. МД - это компьютерная модель** атомов или молекул, описывающая их поведение как механическое, без учета их внутренней структуры. Чтобы создать компьютерную модель, нужны уравнения, то есть нужна математическая/физическая*** модель...

Ю.Б.Дмитриев Концепция унифицирующей субстанции и эволюция Вселенных в двухвакуумной Мультивселенной Аннотация Приведены результаты экспериментальных исследований аномального поглощения тепла веществами в активированных состояниях и с их позиций проведен анализ понятия теплоты в термодинамике и молекулярно-кинетической теории. Для объяснения природы темной энергии фотонный газ введен, как первопричина движения атомов. Ускоренное расширение Вселенной объясняется доминированием фотонного газа «реликтового» фона над гравитацией при больших расстояниях между галактиками, а слияние галактик – доминированием гравитации над фотонным газом «реликтового» фона («реликтовый» взят в скобки, т...