Какие признаки являются для хордовых животных "базовыми"? Это, конечно, сама хорда, спинная нервная трубка и жаберные щели. Самое интересное, что весь этот набор признаков несут только представители подтипа Бесчерепных. Все же остальные (личинкохордовые и позвоночные) являются банальными самозванцами и недостойны нести высокое звание Хордовых, так как нагло отказываются от "хордовых" признаков на разных стадиях онтогенеза. Особенно это касается наглых тетрапод (четвероногих позвоночных), у которых все чистые "хордовые" признаки свойственны только на зародышевой (эмбриональной) стадии...
По данным "молекулярных часов", а также по данным генетики и молекулярной биологии, представители типа Хордовые отделились от остального древа царства Животные задолго до кембрийского периода, когда были найдены точно подтверждённые представители этого типа. И если предки червей, моллюсков и членистоногих худо-бедно прослеживаются в докембрии, то с предками хордовых там как-то туговато. Если изначально хордовых выводили из каких-то групп кольчатых червей или моллюсков (а то и из примитивных членистоногих), то по современным данным вовсе не получается такой простой и ясной картины...