Монофилия - это одно из центральных понятий в филогенетике, и оно принципиально важно для интерпретации полученных результатов. Естественная группа с общей эволюционной историей - это по сути монофилетическая группа. И это то, что мы пытаемся понять, является ли изучаемая группа естественной или нет. Я здесь следую трактовке Хеннига, и даю определения согласно кладистической парадигме. Монофилетической называется группа, которая включает предка и всех его потомков. Монофилетическая группа это синоним термина "клада", потому что клада по определению монофилетична...

Внутренняя и внешняя группы кажутся, на первый взгляд, простыми понятиями. Однако тут есть тонкости, которые важно понимать. Внутренняя группа – это представители тех таксонов, которые мы изучаем. Внешняя группа (outgroup, аутгруппа) – это все то, что не входит во внутреннюю группу (ingroup, ингруппа). Одна из важнейших ее функций – это поляризовать состояния признаков. То есть через внешнюю группу мы понимаем, какие состояния предковые, а какие более продвинутые. В некоторых случаях, внешняя группа - контекст для изучения филогенетического положения внутренней группы, когда такие задачи ставятся...