3 месяца назад
Молекулярная динамика! Силовые поля для расчета биомолекул
К 1980-м годам молекулярная динамика вышла из стадии первых проб и ошибок: компьютеры уже были способны не только рассчитывать траектории одиночных атомов, но и «наблюдать» за движением целых молекул. Однако для реалистичного моделирования биологических систем этого оказалось недостаточно. Требовалось еще научиться корректно описывать саму физику межатомных взаимодействий — ковалентные связи, валентные и двугранные углы, а также невалентные ван-дер-ваальсовы и электростатические взаимодействия. Именно тогда возникла потребность в специализированных силовых полях  — моделях, рассчитанных не на абстрактную...