Человек на протяжении всей своей истории пытался осознать окружающий мир путем деления его на понятные и не смешивающиеся классы объектов и явлений. Так, в каждом языке имеются слова для различных видов растений и животных, выделенных на основе длительных наблюдений за природой. Современная наука разработала новые методы разграничения биологических видов, но принципиально не изменила стремления людей к удобной и непротиворечивой классификации объектов действительности. Однако живая природа, похоже, устроена гораздо сложнее, чем нам бы хотелось...
Последние достижения в области секвенирования ДНК и биоинформатики определили и ускорили последние достижения во всех областях микробиологии. Секвенирование следующего поколения (NGS) вместе с крупномасштабными геномными сопоставлениями позволяет, в частности, определить степень генетической изменчивости среди родственных изолятов и штаммов, а также провести более полный анализ эволюции адаптации, антибиотикорезистентности и факторов патогенности у клинически значимых патогенов. В соответствии с этим, в исследовании Whaley et al...