Фильм начинается с флешбэка. Шао Кан убивает короля Джеррода и захватывает Эдению. После этого он забирает королеву Синдел и принцессу Китану, фактически превращая их в часть своего правления. Этот пролог сразу показывает главную угрозу фильма: Шао Кан — не просто очередной злодей, а завоеватель, который уничтожает целые миры и подчиняет себе их правителей. Проходит около двадцати лет. Десятый турнир Mortal Kombat уже близко. По приказу Шао Кана, Quan Chi возвращает к жизни погибших бойцов — Кун Лао и Кано...