Вся эволюционная теория выстроена на вере в эволюцию. Сама же эта вера в свое время возникла из непонимания механизма возникновения и деструкции осадков во времени. (Подробнее о механизме возникновения окаменелостей и их уничтожении со временем можно прочесть в книге палеонтолога И. А. Ефремова «Тафономия и геологическая летопись. Кн. 1. Захоронение наземных фаун в палеозое». — М.; Л.: Изд-во АН СССР, 1950. — Т. 24. — 178 с. — (Тр. ПИН АН СССР). Как возникла вера в эволюцию? Палеонтологи 19 века обнаруживали в самых нижний слоях осадочных пород морские организмы...
Теперь пришло время подробнее поговорить о признаках на филогении. Это очень важно по двум причинам. Во-первых, положение признаков на филогении может дать нам понимание того, насколько наша филогения адекватна. Если вы видите, что какой-то сложный признак возникает на ней более одного раза, то может возникнуть подозрение, что что-то пошло не так. Во-вторых, эволюция признаков сама по себе может быть одной из целей филогенетического исследования. Как кодировать признаки я объясняла ранее: Часть 1 и Часть 2...