Теперь пришло время подробнее поговорить о признаках на филогении. Это очень важно по двум причинам. Во-первых, положение признаков на филогении может дать нам понимание того, насколько наша филогения адекватна. Если вы видите, что какой-то сложный признак возникает на ней более одного раза, то может возникнуть подозрение, что что-то пошло не так. Во-вторых, эволюция признаков сама по себе может быть одной из целей филогенетического исследования. Как кодировать признаки я объясняла ранее: Часть 1 и Часть 2...

Какой лучший способ определять филогенез, т. е. эволюционное происхождение вида? Один из способов состоит в сравнении генов данного вида с генами других видов. При этом предполагается, что для любых двух видов после разветвления общей линии эволюционного развития разница между их генами будет расти с некой постоянной скоростью вследствие случайных мутаций. Ч. Сибли из Университета шт. Сан-Франциско и Дж. Олквист из Университета шт. Огайо, известные своими работами по применению этого подхода, называемого методом молекулярных часов, изучали в основном филогенез птиц...