Раньше, в те времена, когда знаний о внутреннем строении вещества было маловато, никаких различий между молекулами не замечали. Молекула была молекулой, в понимании мельчайшей частицы вещества.
Но сейчас уже есть хорошее понимание того, что дело в общем-то обстоит не совсем так...
Представьте себе, что ребёнок завёл самую обыкновенную механическую заводную игрушку и пустил её прыгать или ехать по полу. Как же она движется? Отвечая на этот вопрос, придется затронуть физические, биологические, химические явления, а затем и астрономические. А если погрузиться в тему достаточно глубоко, то можно пуститься в объяснения космологических процессов и, в конце концов, дойти до колоссального выброса энергии при Большом взрыве. Но мы, пожалуй, остановимся на термоядерных реакциях на Солнце...