Фильм начинается с того, что Соник — антропоморфный синий ёж с невероятной скоростью — живёт на далёкой планете. Он вынужден бежать от врагов, которые хотят использовать его силы. Его наставница — сова Лонгклоу — даёт ему магические кольца, которые открывают порталы в другие миры. Соник телепортируется на Землю и обосновывается в маленьком городке Грин-Хиллс в штате Монтана. Он живёт тайно, наблюдая за людьми, особенно за шерифом Томом Вачовски и его женой Мэдди. Соник одинок, но не вмешивается в жизнь людей...

До того, как Соник отправляется на Землю, он живет в зеленом раю, смоделированном на основе первого уровня его дебютной видеоигры (об этом чуть позже). К сожалению, блаженное детство Соника длится не долго. Оказывается, все хотят получить его сверхскорость, включая племя животных, которые его преследуют. Это не просто какие-то создания, преследующие Соника во время пролога. Они являются членами клана Наклз - племени ехидн, которое первоначально появилось в рекордной серии комиксов Соник от Archie Comics...