После событий первой части вирус T вырывается за пределы лаборатории корпорации Umbrella и распространяется по всему Раккун-Сити. Элис приходит в себя в разрушенном госпитале и понимает, что город охвачен пандемией: люди превращаются в зомби. Она присоединяется к Джилл Валентайн, бывшему спецназовцу Карлосу Оливейре и другим уцелевшим. Они пытаются покинуть город до того, как военные решат уничтожить его с помощью ядерного оружия, чтобы скрыть следы происшествия. На их пути возникает мутант Немезис, созданный корпорацией Umbrella для уничтожения отряда STARS...