Сериал имел целых три рабочих названия — «Москва бандитская», «Сага о криминале», «Во имя отца и сына». В сценарий сериала «Крот» вошёл ряд сюжетных линий, которые были подготовлены для продолжения 5-серийного фильма «Рэкет», съёмки продолжения которого не удалось осуществить из-за скоропостижной кончины актёра Сергея Шкаликова, игравшего в одну из главных ролей. Некоторые прослеживают связь между этими двумя сериалами. Они считают, что адвокат Сабур из «Рэкета» и наркобарон Сабур из «Крота» — один и тот же персонаж...

Двух актеров сериала обвинили в серьезных преступлениях, среди которых сопротивление полиции, захват заложников, умышленное причинение вреда здоровью и незаконное хранение оружия. Одному из них суд вынес ему приговор в виде лишения свободы сроком на 16 лет. Его имя Аднан Коч и он известен зрителям Великолепного века по роли Бехрама паши. 36-летнего актера и пятерых других подозреваемых арестовали в марте 2018 года по подозрению в хранении и распространении запрещенных веществ. В числе арестованных оказался и другой актер «Великолепного века» Серхан Онату...