Кики — 13-летняя ведьма-ученица, живущая на окраине маленького городка с отцом-учёным и матерью-ведьмой, изготавливающей целебные средства для местных жителей и обучающей дочь своему искусству. В таком возрасте, по традиции, ведьма должна улететь на годичную стажировку в чужой город, где нет других ведьм, и пожить за счёт предоставления его жителям своих профессиональных услуг. Мать беспокоит, что из всех нужных ведьме умений дочь освоила лишь полёт на метле, но Кики уверена в своей способности пройти испытание...

По достижению 13-ти летия каждая ведьма по древней традиции должна отправиться в мир людей и прожить год, принося пользу. Вместе с говорящим котом Зизи (яп. Джи-Джи), девочка Кики отправляется навстречу приключениям. Она выбирает город, устраивается на работу в службу доставки пекарни (ведь может летать на метле по городу) и находит друга Томбо. Вместе ребята делают для себя много открытий, учатся новому и становятся взрослее. Томбо говорит о том, что останется ли удовольствие от полёта, если он станет работой...