Zetman! События разворачиваются в альтернативной Японии нашего времени. Корпорация "Амаги" в тайне от общества создает генетически модифицированных существ, так называемых Игроков. Существа вынуждены биться на смерть, участвуя в гладиаторских боях, развлекая богачей. Однако, в один прекрасный момент Игроки восстали против своих создателей и сбежали, уничтожив при этом базу Амаги и всех, кто попадался у них на пути. Немногим ранее ученым удалось создать более совершенный вид существа, которого назвали Зет...

Зетмен Джин странный ребенок с маркой ангела на руке. Он живет бедной, но мирной жизнью со своим дедом, наряду с другими нищими и оставленными бомжами около реки. Однажды его мирная жизнь меняется, когда появляется странный монстр по имени «игрок», отрубая головы и убивая всех, кто появляется перед ним. Хаматора В этом мире люди делятся на два типа Держатели Минимума со способностями и обычные. Правительство организовало специальную элитную академию для таких людей, чтобы они могли развивать свои навыки и служить национальным интересам...