Четвёртый, «Паучьи войны», состоящий из 2 эпизодов, мадам Паутина знакомит Питера с его двойниками из параллельных миров. Их пятеро: Они должны действовать вместе, ведь враг опасен — ещё один двойник Паука — Паук-Карнаж. Он жаждет уничтожить всё живое, все реальности, все вселенные, все миры (объединившийся с Зёленым Гоблином и Хобгоблином). В итоге Человек-Паук со своей командой одерживает верх. А мадам Паутина делает самый лучший для Питера подарок — сообщает, что Мэри Джейн Уотсон жива, и он найдёт её...

"Человек-паук: Паутина вселенных" Как и в некоторых других фильмах Марвел, начиная с четвертой фазы, в "Человеке-паук: Паутине вселенных" особое внимание уделяется мультивселенной. В конце анимационного фильма Майлз Моралес, надеясь попасть домой, случайно перемещается в другую вселенную, в которой нет Человека-паука. Из-за этого город Майлза становится похож на Готэм, в котором процветает преступность и нет никаких проблесков надежды даже в слоганах известных компаний. К примеру, культовая фраза "Just Do It" от Nike в фильме написана, как "Don't Do It", а сам логотип перевернут...