Первый сезон выпущен в эфир в декабре 1987 года. Первый сезон состоит из пяти эпизодов, которые стали пилотными. Во всех эпизодах первого сезона Технодром располагается под Нью-Йорком. Краткий список серий: 1. По следам черепашек Нью-Йорк переживает волну преступности. Репортер Эйприл О'Нил обнаруживает воров являющихся ниндзя. Уличная банда нападает на Эйприл, она сбегает в канализацию, где её спасают черепашки. От их вида она падает в обморок, и черепахам не остается ничего другого, как отнести её к себе на базу...
В 21 серий 2 сезона Черепашек ниндзя 2003 года выпуска случилось так что главный злодей мультсериала Шредор захватил мир и правит им суровой рукой. Здесь мы можем увидеть к чему привело его правление и как он не собирается на этом останавливаться, а теперь поговорим по подробнее. Сюжетка В 20 серий случился распад черепашек, их всех переместило в другое время или вселенную, от сюда уже и берет свое начало 21 серия. Донатело отправляют в будущее, где Донатело пропал и команде Черепашек ниндзя пришлось спасать мир уже троем, без Дони...