Эта история начинается в начальной школе «Небожителей», где происходят таинственные исчезновения учеников. Весь город взбудоражен этими событиями, и вскоре удаётся найти виновника — сумасшедшего учителя, перерезавшего своих жертв ножницами. После этих трагических событий школу сносят, а на её месте возводят другую под названием Академия Кисараги. Но события прошлого продолжают влиять на это место. Однажды ночью, группа учеников, тайно пробравшихся в школу для испытания на храбрость, попадет в таинственное другое измерение...