Кланнад - это первая часть путешествия между Томоя Окадзаки и Нагиса Фурукава. Эта история следует за очень непонятым мальчиком по имени Томоя и его отношениями с различными людьми в его средней школе, особенно с Нагисой, с которым дружба романтически растет с течением времени. Томойя впервые замечает Нагису, когда она одна кричит случайные вещи, привлекая внимание Томои. После этого инцидента Томойя становится более осведомленной о присутствии Нагисы в школе и обнаруживает, что она на самом деле старше на класс, но сдерживается, потому что она часто была слишком больна, чтобы покинуть дом...