Скуби-Ду, Шэгги, Дафна, Фред и Велма должны разгадать одну страшную тайну, которая связана с поселившимся здесь призраком. Этот призрак никому не даёт покоя ни днём, ни ночью, поэтому от него следует как можно быстрее избавиться. Узнала об этом призраке Дафна, которая занимается тем, что собирает материал о привидениях и призраках. Информация ей нужна, потому что она репортёр и работает на телевидении. Однако, расследовав некоторые истории из собранных, друзья вдруг обнаруживают, что под маской призраков очень часто скрываются самые обычные злоумышленники...

«Скуби-Ду 3: Тайна начинается» — фильм-комедия 2009 года. По сюжету является приквелом к первой части фильма о Скуби-Ду и рассказывает о возникновении «Мистической Корпорации». Актёрский состав совершенно новый, единственным оригинальным актёром остаётся Фрэнк Уэлкер, голос Скуби-Ду. В Кулсвилле, Огайо, проводится ярмарка по усыновлению домашних животных. Скуби-Ду хотят усыновить, но он никому не нужен. Позже, на обратном пути в приют, Скуби случайно остается позади, когда ящик, в котором он находится, падает с грузовика...