В "Войнах клонов" показан еще один способ выживания молодых джедаев после Приказа 66, но он гораздо мрачнее и может привести их на Темную сторону. Палпатин издал Приказ 66 в самом конце "Войн клонов", и армия клонов ополчилась на джедаев по всей галактике. Исполнение Приказа 66 было показано во множестве различных материалов по "Звездным войнам" и даже в "Звездных войнах: Войны клонов", 7 сезон, когда 332-я рота обратилась против Асоки Тано. Приказ 66 был частью плана Палпатина по превращению в Императора, поскольку джедаи были единственной силой, стоявшей на его пути...