"Школа мертвецов" начинается с обычного дня в старшей школе, который быстро превращается в кошмар, когда мир охватывает зомби-апокалипсис. Главные герои — группа школьников и медсестра — оказываются в эпицентре событий и вынуждены бороться за свою жизнь, пытаясь найти безопасное место и понять, что происходит. Сюжет аниме сосредоточен на выживании в условиях зомби-апокалипсиса. Группа героев сталкивается с множеством проблем: нехватка еды и воды, угроза со стороны зомби и других выживших, а также собственные внутренние конфликты...