Событие второй части манги происходит спустя два с половиной года их странствий с Дзирайей. Вернувшийся в Коноху и повзрослевший Наруто стал более сильным и умным, но, в отличие от сверстников, остался в звании гэнина. Первой крупной миссией стало спасение похищенного группировкой Акацуки Гаары: в то время как Сасори был уничтожен Сакурой и Тиё, Наруто вместе с Какаси преследовал Дэйдару, которому всё-таки удалось сбежать, сымитировав свою смерть. Ослабленный использованием в погоне сярингана Какаси...

В изначальной версии Наруто мы наблюдаем крайнее агресивнго , так же мы видим изначальную версию Курамы,если мы помним что при сражение с Курамой погиб Хокаге ,но в данной истории погибло 8 сильнейщих войнов Хирузен был представлен как один сильнейщих войнов девяти Отец Наруто был представлен Курама,изначальная концепция была на деменов и людей Но одна черта для обоих Наруто есть всегда,они оба любят рамен) Так же в этой версии Наруто,так же был одинок,и Хирузен его отправил на поиски друзей,чтобы...