Сюжет данной современной японской анимации повествует о двух мирах, существующих вместе: морском мире и человеческом мире. Первое, что мы видим, — это сказочный подводный мир, в котором царит идиллия. Рыбка прощается со своими маленькими сестрами и тихо уплывает из своего дома на дневную вылазку в открытое море. Плавая в море, она попадает в рыболовные сети, от чего её отбрасывает на берег, где её находит пятилетний мальчик Сооскэ. Сооскэ решает спасти рыбку, угодившую в банку, когда-то выброшенную человеком в море...

О мультфильме: Маленькая любопытная рыбка Поньо — дочь колдуна и прекрасной морской богини — уплывает из дома, чтобы понаблюдать за жизнью людей. Поньо застревает в банке и оказывается выброшенной на берег. Её подбирает пятилетний Сосукэ. Малыши привязываются друг к другу, и теперь у Поньо только одно желание — стать человеком...