Как только Мегамозг вышел за тюремные ворота, он щелкнул выключателем часов и принял свой облик. Это был подручный Мегамозга Наймит, уже совсем взрослый! - Ну, привет. Подвезти? - спросил Наймит. - Разумеется, моя фантастическая рыбка! - ответил Мегамозг, залезая внутрь. - Я свободен! Я свободен! - радостно воскликнул Мегамозг, удобно устроившись в автомобиле. - Отличная идея послать мне часы, Наймит. - Главное, вы их получили, босс, - ответил Наймит. Мегамозг обернулся и посмотрел на Роксану Ритчи, всё еще без чувств лежавшую на заднем сиденье. - Мисс Ритчи, - обратился он к ней, хотя и знал, что она его не слышит...

Итак, мультфильм "Мегамозг" рассказывает нам классическую историю про злодея, который пытается захватить Метро-сити. Но ему противостоит полностью неуязвимый герой – Мачомэн. Зрителю показывают, как они ведут между собой "войну" за этот город, причём продолжается это очень долгое время. И первым из них решает сдаться Мачомэн, потому что ему начинает надоедать постоянная "оборона" города. Мачомэн решает поддаться в битве с Мегамозгом и проиграть. Таким образом, Мегамозг становится главным в Метро-сити...