Событие второй части манги происходит спустя два с половиной года их странствий с Дзирайей. Вернувшийся в Коноху и повзрослевший Наруто стал более сильным и умным, но, в отличие от сверстников, остался в звании гэнина. Первой крупной миссией стало спасение похищенного группировкой Акацуки Гаары: в то время как Сасори был уничтожен Сакурой и Тиё, Наруто вместе с Какаси преследовал Дэйдару, которому всё-таки удалось сбежать, сымитировав свою смерть. Ослабленный использованием в погоне сярингана Какаси...

Эпизод 13 "Судьбоносная встреча". Намечаются две битвы. Первыми с противником встречаются Гай и ко. И это Мечник Скрытого Тумана - Кисаме, который тут же использует Взрывную Волну. Хотелось бы вспомнить, что Кисаме быстро превратил местность в, как минимум, небольшое озеро с бушующими волнами. А у него ведь всего 30% чакры.. как он их все не растратил уже на этом этапе? На самом деле эта техника имеет всего навсего В-ранг, и существует более масштабное дзюцу, а именно Суитон : ВЕЛИКАЯ Взрывная Волна, которую он уже будет использовать в сражении с Киллер Би...