Харуки и Мио одноклассники. Он увлечен кинематографом, она живописью. Со стороны они выглядят парой, но на самом деле никак не преодолеют те самые десять сантиметров. Судьба преподнесет им препятствия и поставит перед выбором. Делать ли шаг ближе друг к другу решать только им… Романтическая история первой любви описана в нежных тонах и на трогательных нотах. В нее плавно будут вплетены подростковые проблемы самоопределения, страхи перед будущим, важность слышать свой внутренний голос, ощущать поддержку близких, верить в себя и свою мечту...

В аниме «Пять сантиметров в секунду» рассказаны три истории из жизни Тоно Такаки, охватывающие 18 лет его жизни. Они описывают его слабеющую связь с девушкой по имени Акари, которую он когда-то любил. Действие первой истории происходит в школьные годы, когда Такаки сквозь непогоду пытается в последний раз увидеться с Акари. Вторая история также происходит в школьные годы. Такаки всё еще думает об Акари, не подозревая о чувствах другой девушки – Канаэ, которая влюбилась в него. Действие третьей истории происходит уже со взрослым Такаки...