Основная концепция игры, обозначенная как «сверх-слияние» (super-fusion) игрового процесса и анимации, была сформулирована четко и однозначно:(«Играй, как будто живешь в мире аниме»). Эта идея стала краеугольным камнем для всех последующих решений. Разработка велась в течение 23 месяцев (с ноября 2008, сразу же после релиза Первого Шторма, по сентябрь 2010 года) силой растущей команды. Организационная структура была гибкой: начиналось всё с ~30-40 человек на этапе прототипирования, а к финальной стадии над проектом работало уже около 80 разработчиков...

Автор манги, Масаси Кисимото, не раз объяснял, почему в финале «Наруто» герой выбрал именно Хинату. Создатель манги отмечал, что Хината появилась в сюжете одной из первых и с самого начала поддерживала Наруто, несмотря на его неудачи. Эта неколебимая позиция изначально определила дальнейшее развитие их отношений. Кисимото подчеркивает: Хината не случайно оказалась рядом с Наруто в конце истории; она была его единственным сторонником ещё в детстве. Автор говорил: «Хината всегда была единственным ребёнком, который поддерживал и подбадривал его...