Событие второй части манги происходит спустя два с половиной года их странствий с Дзирайей. Вернувшийся в Коноху и повзрослевший Наруто стал более сильным и умным, но, в отличие от сверстников, остался в звании гэнина. Первой крупной миссией стало спасение похищенного группировкой Акацуки Гаары: в то время как Сасори был уничтожен Сакурой и Тиё, Наруто вместе с Какаси преследовал Дэйдару, которому всё-таки удалось сбежать, сымитировав свою смерть. Ослабленный использованием в погоне сярингана Какаси...

Эпизод 75 "Молитва старика-священника". Расследование команды Асумы. Магия чисел Команды рассредоточились по своим направлениям, ну, и конечно же, самая мудрая мысль пришла команде Асумы, то ли, потому что в её составе Асума и Шикамару, то ли это непосредственный приказ Цунаде-сама, которая знает, что Асуму, как близкого Чирику человека, необходимо отправить в центр событий(а заодно и гениального чунина) - они пришли в разрушенный Храм Огня. Итак, немного забавной математики: нам показывают череду гробов - тела тех, кто погиб при налёте Акацки...