Событие второй части манги происходит спустя два с половиной года их странствий с Дзирайей. Вернувшийся в Коноху и повзрослевший Наруто стал более сильным и умным, но, в отличие от сверстников, остался в звании гэнина. Первой крупной миссией стало спасение похищенного группировкой Акацуки Гаары: в то время как Сасори был уничтожен Сакурой и Тиё, Наруто вместе с Какаси преследовал Дэйдару, которому всё-таки удалось сбежать, сымитировав свою смерть. Ослабленный использованием в погоне сярингана Какаси...

Эпизод 47 "Проникновение! Логово Ядовитого Змея" Взаимоотношения Саске и Орочимару Наконец-то, спустя столько времени, мы встречаем Саске, пафосно восседающего у статуи змея. Парень остался так же холоден ко всему происходящему, как и раньше, правда сейчас его "холодок" относительно возрос, ведь во всех ближайших сценах мы не увидим даже, знакомой с первого сезона, высокомерной ухмылки и игривых настроений. А точнее, одна ухмылка будет прямо сейчас, но и она отличается от прежних(сейчас до этого дойдём)...