Полным ходом шла Третья Мировая Война Шиноби. Узумаки Нагато стал сиротой, после того как шиноби из Скрытого Листа расправились с его родителями. В порыве ярости, сам того не зная, смог использовать риннеган, самое мощное в мире додзюцу, которым обладал Рикуда Саннин, переданный ему от Мадары, и убить тех шиноби. Он скитался совсем один без одежды, еды и крыши над головой. Вскоре он встретил Яхико и Конан, таких же сирот как и он. Они выживали как могли. Им приходилось воровать еду. Через некоторое время они встретили 3-ёх саннинов...

Многие аспекты прошлого персонажей значимо влияют на их жизнь, но есть аспекты их предыстории, которые практически не имеют смысла. Многими персонажами Наруто движет боль прошлого. На жизнь главного героя сильно повлиял тот факт, что его родители умерли, когда он был новорожденным. Другие персонажи были определены отдельными моментами их собственных историй. Многие аспекты прошлого персонажей значимо влияют на их жизнь, но есть аспекты их предыстории, которые практически не имеют смысла. И злодеи, и герои Наруто были сформированы постоянными войнами...