Морфеус рассказывает Нео, что человечество создало искусственный интеллект, а затем вступило с ним в войну. Люди проиграли, машины превратили их тела в источник энергии и построили виртуальный мир, где пленники проживают чужие жизни. В его версии есть заметная дыра: никто толком не знает, кто нанес первый удар. Разрушенные города, черное небо и бесконечные поля с капсулами показывают уже последствия катастрофы, поэтому машины выглядят обычными захватчиками, которые однажды решили поработить своих создателей...