Уникальность этого аниме в том, что в нём нет чёткого разделения на тёмную и светлую стороны, добро и зло. Есть две противоборствующие стороны: гули (упыри) и охотники за ними, следователи (голуби). Так, гули, которые родились упырями, пытаются жить бок о бок с людьми, ищут альтернативу кровавой охоте. Не все, конечно, но есть и миролюбивые. Также обстоит ситуация со следователями. Все они дают клятву защищать людей, а к устранению гулей должны относится как к необходимой мере. Но в мс есть голуби, которые забывают о морали...
Аниме «Токийский гуль» рассказывает историю студента колледжа по имени Кэндэй Кудзэ, который после нападения Гуля чудом остаётся жив благодаря вмешательству другого Гуля — Ризе Какури. Он спасает парня, поделившись с ним своей «Кьюби» — веществом, которое превращает людей в кровожадных монстров. Так Кэндэй становится полугулем и присоединяется к команде «Куинкс», члены которой занимаются уничтожением диких Гулей. Однажды в Токио учёный по имени Макото Хинами проводит эксперимент, в ходе которого случайно открывает врата в иной мир, откуда проникает странное вещество под названием «Кьюби». Попав в человеческое тело, оно превращает своего носителя в кровожадного монстра, известного как Гуль...